胎糞吸入綜合徵的原因有以下因素引起，胎兒在宮內或者分娩過程中出現缺氧，導致腸道血流量減少，腸壁缺血，腸蠕動增快，引起肛門括約肌鬆弛而排出胎糞。缺氧後胎兒呼吸運動加快加深，將胎糞吸入氣管內或肺內。當胎兒娩出後，建立有效呼吸後，將咽喉部胎糞吸入肺內。胎糞吸入綜合徵的發生率與胎齡有關，多見於足月兒和過期產兒。