小兒急性感染性心內膜炎會發燒的，而且一般以發熱最為常見。其次，患兒還可能會出現肺炎、骨髓炎、皮膚感染、腸炎等其他部位的炎症，由於累及的臟器不同，所以臨床症狀也有一定的差異。小兒急性感染性心內膜炎一般是以全身感染性症狀、心臟以及栓塞血管所引發的症狀常常累及心臟瓣膜，一般患兒都有原發性心臟病變，感染的病菌以草綠色鏈球菌感染多見。