小兒亞急性感染性心內膜炎的病理變化有：第一，病損部位的心內膜或者心膜瓣上會有贅生物形成。此地方吞噬細胞較少，藥物就難以達到深處，細菌不易殺滅。局部細菌滋生可能是瓣葉產生潰瘍或穿孔。第二，贅生物大，而且容易碎，脫落可能會導致周圍和器髒髮生動脈栓塞，涉及心臟，肺部，大腦，腎臟，脾臟，而且容易出現多發性小膿腫。