小兒急性感染性心內膜炎的主要病因是由於鏈球菌感染和葡萄球菌感染瓣膜引起的疾病，跟孩子先天性的瓣膜關閉不全有關係，常見的病因是由於孩子抵抗力差，一些細菌感染或者是病毒感染，沒有及時治療或者是治療不徹底，侵犯心臟內膜引起，由肺炎球菌，淋球菌，流感桿菌等導致，小兒感染性心內膜炎以自體瓣膜疾病引起的為多見，治療上主要是抗微生物的治療，根據具體的病原體選擇抗生素，以青黴素鈉為主和手術治療。