急性感染性心內膜炎致病菌毒性較強，常見有金黃色葡萄球菌、鏈球菌、真菌。其中葡萄球菌感染為靜脈藥物濫用引起的感染性心內膜炎的最主要原因。心臟起搏器感染多為表皮葡萄球菌和金黃色葡萄球菌感染，真菌多見於心臟手術和靜脈注射麻醉藥物成癮者中。急性感染性心內膜炎，病情進展快，幾天到幾周就可以引起心臟瓣膜的破壞，出現心臟的雜音，或者原有心臟雜音發生改變，可以迅速出現急性心衰。