一旦臨床確診為急性細菌性心內膜炎，必須立即住院治療。本病的預後取決於治療的時間，越早治療效果越好。首先要應用抗生素治療，可以選擇青黴素類或者聯合其他藥物如鏈黴素等治療。在應用抗生素過程中，如果出現心力衰竭，積極糾正心力衰竭治療，同時要考慮更換抗生素治療的問題。如果有栓塞，需要及早手術，避免惡化失去手術的最佳時機。