嬰兒痙攣症為難治性癲癇，預後不良，發作難以控制，多數患兒會遺留智力和運動發育落後的問題，主要治療方法有以下幾方面：
1、藥物治療，如氨己烯酸片口服，已被證明是控制嬰兒痙攣症，特別是有結節性硬化症的兒童相當有效的藥物；
2、促腎上腺皮質激素肌肉注射，口服抗癲癇藥物，例如左乙拉西坦、丙戊酸鈉、拉莫三嗪等，大劑量服用維生素B6；
3、生酮飲食，此方法是一個脂肪高比例、碳水化合物低比例、蛋白質和其他營養素合適的配方飲食，既不影響正常的生長發育，同時又具有治療癲癇等疾病的作用；
4、手術治療，如果癲癇發作是由局部腦異常引起，可以通過手術治療。