一歲三個月寶寶消化不良可以在醫生指導下服用益生菌來治療，益生菌對於調理腸胃動力等方面是有較大作用的。父母也可以給患兒服用一些具有助消化作用的藥物治療，比如胃蛋白酶等。對於消化不良比較輕的患兒，父母可以通過飲食調理改善，比如讓孩子吃蒸蘋果，可以起到幫助消化的作用。也可以嘗試給孩子做腹部的按摩幫助胃腸消化。