兒童心肌緻密化不全沒有特殊的治療方法，治療主要是針對病情來治療。如果在兒童階段，心肌緻密化不全沒有任何臨床症狀，那麼就不需要治療，只需要定期複查。因為有一部分患者可能需要等到中年才會有病症表現。心肌緻密化不全主要是有可能會引起心律失常，心力衰竭等等。如果在兒童階段就出現這些表現，那麼對於心律失常需要使用抗心律失常的藥，而對於心力衰竭，則需要使用強心劑利尿劑等藥物治療。