肥厚性心肌病的治療原則就是根據患者的具體身體狀況制定適合自己的治療方案，是需要個體化的，主要是減輕左心室流出道梗阻，改善心室的順應性，防止血栓事件預防措施。要避免過於勞累，不能情緒激動或突然用力防止便秘，如果有增加心肌收縮力的藥物，貝塔受體激動劑異丙腎上腺素或洋地黃是不能用的，因為它們會加重左心室流出道梗阻。