腦血管堵塞最好的治療方法，與病人所處的時期及是否伴有嚴重血管狹窄有關。如果是發病的急性期4.5小時之內，建議靜脈溶栓治療。發病6小時之內，建議支架取栓治療。在急性期發病6小時至發病一週左右，建議應用抗血小板、改善循環、腦保護治療，必要時給予抗凝或降纖治療。
一般超過1-2周的急性期之後進入康復期，建議正規康復治療，前三個月為黃金時期。如果伴有明顯的嚴重顱內血管狹窄，建議支架治療。無法行支架成形術，可以考慮進行搭橋治療。如果病人的腦血管堵塞有免疫因素的參與，比如多發性大動脈炎或中樞神經系統血管炎等，應用針對免疫方面的激素或丙種球蛋白治療。