支氣管結核是肺結核的一個特殊類型，是指結核桿菌僅僅侷限在支氣管內，有時候也稱作支氣管內膜結合。其治療同樣需要遵循肺結核治療的方案，具體就是多采用短程療法，在前兩個月使用，包括異煙肼、利福平、吡嗪酰胺、乙安丁醇等藥在內的抗結核治療；後4個月使用異煙肼和利福平抗結核治療。如果出現耐藥菌株，可以加用左氧氟沙星或者鹽酸莫西沙星，治療時間延長到9~10個月。在治療用藥的過程中，患者應定期複查結核病灶的吸收情況以及監測肝腎功能。