大多數支氣管結核是能夠治癒的。通過早期的診斷和明確病情，進行聯合、足療程、規範、適量、規律的抗結核治療是完全可以治癒的。支氣管結核是肺結核的一種特殊類型，通常的雙肺的x光片、ct或者核磁共振的影像學的檢查是正常的表現，看不到任何肺部的結核感染病灶。而且一部分患者通過痰檢或者培養結核桿菌均為陰性。一般需要通過支氣管纖維內鏡檢查，甚至取活組織做病理檢查，才能明確診斷，所以臨床上會有一部分支氣管結核患者被漏診。這部分患者由於沒有及時的早期的明確診斷和規範的治療，很可能會導致支氣管胸膜瘻，甚至出現耐多藥性肺結核等，容易治療不徹底，患者的免疫功能比較差，而導致支氣管結核遷延不愈。