十二指腸潰瘍穿孔為臨床常見的急腹症，其發病較急，病情較重，如不緊急處理，有可能危及生命。其治療可分為手術治療和非手術治療兩種方式。手術治療可以分為兩種，一種為單純性穿孔縫合術，因為十二指腸潰瘍在理論上沒有惡性，所以在穿孔時間超過8小時，腹腔內感染較重，有較多的膿性滲出液，沒有出血和梗阻等併發症，以及患者年齡較大，有其他基礎性疾病不能耐受長時間手術的患者，可以行單純穿孔縫合術。大多數情況下應該行徹底的潰瘍切除術，其優點是一次手術同時解除了穿孔和潰瘍兩個問題。穿孔在八小時內或超過八小時但腹腔汙染不嚴重的患者可行此手術。手術的方法最常見的是胃大部切除術。此外對一些一般情況較好，腹部體徵較輕的空腹穿孔、穿孔超過24小時的腹膜炎已經侷限的患者或者經水溶性造影劑泛影葡胺行胃十二指腸造影檢查證實穿孔已經封閉的病人，在沒有出血和幽門梗阻等併發症的情況下，可以行非手術治療。非手術治療的主要措施包括持續胃腸減壓，維持水電解質平衡，並給予營養支持，應用抗生素控制感染，靜脈給予質子泵抑制劑等抑酸劑抑制胃酸的分泌。