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精子質量差只是一個結果，是不同病因導致的，因此治療方式是不一樣的。如少精子症，部分患者是因為睪丸產生精子的能力質量異常，部分患者是因為輸精管道通暢性，還有患者是性生活的興奮程度射出來的精子數量少，不同的病因導致的結果可能是相同的。但是相同結果、病因不同 的情況下，治療原則也是不同的。精子數量少，主要是要分析是什麼病因，是需要生精，還是需要疏通生精的管道，不同病因的治療方案是不同的。一般來說，醫生很少會根據一張精液報告進行直接的治療，首先需要複查精液，核實完精子的質量確實是差，才做相應的病因分析，病因分析之後才做相應治療。
精液顏色發黃首先需要區分清楚，是禁慾時間太長還是感染引起的，這兩種情況都會導致精液顏色發黃。如果是禁慾時間太長，在體內儲留時間太長的情況下，顏色也會相應發黃。禁慾時間，如果控制在3-7天或者在10天以內的情況下，精液的顏色相對是灰白色，如果禁慾10天以上可導致 精液顏色發黃，不一定需要進行治療。此外還要觀察其他的伴隨症狀，有沒有尿頻、尿急、尿痛等，根據不同的情況具體分析。如果是感染原因引起的精液顏色發黃，一般來說，要分析精液裡面的炎症是哪種病原菌感染引起的，選擇針對性藥物進行治療，效果相對會比較好。
男士孕前檢查，如果到綜合醫院，建議掛號男科，可以掛生殖中心男科或者泌尿外科男科，沒有男科可以掛號泌尿外科，如果到中醫院，可以掛男科或者泌尿外科。男性孕前檢查通常包括以下幾個方面：
精子質量差是一個綜合參數，如精子數量少、精子活力差或者精子形態差。一般單純的精子活力少，中醫和西醫有兩種不同的理論，西醫理論認為精子的生成過程中出現問題，或者精子的儲存過程中出現問題。如果精子生成過程出現問題時，需要要改 善睪丸的生精環境。如果是精子的儲存環境出現問題，則要改善精子的儲存環境，也即是附睪，附睪的環境到底好不好，臨床上有相應的檢查或檢驗可以區分。如果是中醫的說法，有一句話叫做形不足者補之以氣，比如弱精症，一般來說採用補腎溫氣、補氣的治療方法，可以達到相應的治療效果。精子的活力差的具體程度也有區別，病因或治療也是有區別的。輕度弱精子症，一般來說是單純的生活習慣原因或外界環境原因，或者精子儲存環境出了問題，此類患者一般治療效果相對會比較好。如果是精子嚴重異常，用藥物治療效果可達到一定程度的改善。但是治療需設好治療目標，即是把精子活力盡量提升，從而有利於懷孕。
精子少的原因可從中醫和西醫兩個方面分析，具體內容如下：1、西醫：一般考慮睪丸產生精子的能力下降，或輸精管道不完全梗阻。如果是睪丸產生精子的能力下降的情況下，還要區分是營養不夠型還是營養過高型；如果體內激素水平達到一定值或者非常高的情況下，可能睪丸對這種營養的能力吸收偏差，此時再補充營養，效果比較差；如果是激素水平或營養水平不夠的情況下，通過補充營養或者單純的調理營養的吸收能力來配合治療，效果相對會比較好；2、中醫：考慮到睪丸的生精功能不足，中醫認為精不足者，溫之以腎，補之以味，即是說如果是少精症，多考慮是睪丸產生精子能力偏差，可採用溫腎、補腎填精的治療方法。
精子頭部缺陷，首先從常規形態學角度來說，精子頭部缺陷包含大頭、小頭、錐形頭、梨形頭、圓頭、不定形頭、有空泡的頭，頂體後區有空泡。以及頂體區域過小或過大，頂體區過小指頂體區小於整個精子頭部面積的40%。頂體區過大指頂體區域大於精子頭部整體面積的70%。雙頭、多頭以及缺陷的頂體組合，因為精 子頭部包含頂體酶和遺傳物質，所以如果精子頭部缺陷率過高，就會導致精子和卵子發生頂體反應時。由於酶缺陷或酶不夠，所以導致無法發生頂體反應，而出現精子和卵子不結合，也就是經常說的不受精，或由於頂體後區DNA物質受到影響，即使發生了頂體反應受精，受精後也無法形成胚子，或胚子形成之後，可能會導致胚胎不發育、胚胎髮育停滯或流產。一般情況下，一個精子和一個卵子結合，常規一份精液標本里面存在正常的精子比例非常多，所以畸形精子、頭部有缺陷的精子和正常精子相比，正常精子更容易和卵子結合。
精子畸形率問題本身不是應該過度關注的問題，從常規思維來講，精子畸形有可能影響到生育，影響懷孕，影響孩子質量。但實際上男性精子是用千萬來衡量的，千萬裡面只要存在正常的精子，首先是正常精子和卵子結合，畸形精子和卵子結合的概率就降低。所以精子畸形率不應該過度關注。一般 情況下精子畸形率高的，如正常精子比例不到1%，或全部都是畸形精子，如經常能見到圓頭精子，是不可能跟卵子結合導致不孕症的。所以在關注精子畸形率時，除非是全部精子都存在畸形，否則不孕症的人去關注精子畸形率的意義更高，而不是考慮孩子質量和精子畸形到底存在多少關係。