扁平疣臨床較常見，屬於疣的一種。疣主要包括尋常疣、扁平疣、蹠疣和尖銳溼疣等，主要由人乳頭瘤病毒，即HPV病毒感染皮膚黏膜而引起的皮膚黏膜良性贅生物。

HPV病毒有150多種不同亞型，其中近80種與人類疾病息息相關，某些亞型傾向於感染特定的身體部位。HPV病毒主要經直接或者間接接觸傳播，尤其是感染破損的皮膚黏膜或者機體免疫功能低下患者。正常皮膚也可發生HPV潛伏感染，潛伏期大約為2-6個月，HPV宿主可以呈現臨床或者亞臨床感染狀態。皮膚黏膜感染人乳頭瘤病毒之後，病毒在細胞內大量複製和繁殖，從而導致上皮細胞異常增生和分化，引起皮膚黏膜良性贅生物。