沙眼衣原體陽性，主要是通過性接觸傳染所導致的，臨床上絕大部分這類病人有高危性生活史或者多個性伴侶，才會導致沙眼衣原體的感染，所以我們國家將沙眼衣原體感染列為性病當中的一種。

並不是所有的沙眼衣原體感染都是由於高危的性生活史所導致的，比如有人如果穿過病人的內褲，那麼可能會導致感染；如果是公共場合，比如在浴池洗澡的時候，病人坐過的地方，別人再去坐，也可能會造成間接的感染。