腳趾甲出現變厚發黃內空最常見的原因是真菌感染即灰指甲，真菌易從皮膚蔓延到指甲引起腳趾甲真菌感染。

腳趾甲是真菌感染的高發部位，尤其是大拇腳趾，大拇腳趾出現變黃變空、剪指甲有碎屑時真菌感染的可能性大，需要到醫院做真菌檢查，包括真菌鏡檢、真菌培養。

如有一個陽性且有培養出真菌、看到真菌成分，則提示皮膚癬菌，可確診灰指甲。