胃鏡對胃無傷害，是安全的檢查。胃鏡通過口腔經過咽喉部再到食道、胃、十二指腸等部位。在胃鏡下通過管內一個小孔，再進去一個小夾子，取米粒大小胃黏膜並在顯微鏡下觀察有無炎症、幽門螺桿菌感染、腫瘤細胞等。

取2-3顆黏膜對胃並無損傷，取好後在胃鏡下觀察到有較少出血，當即治療並無任何傷害。胃鏡有一定風險，如凝血功能不佳可能出現消化道出血，或十二指腸結構異常、病變，做胃鏡有可能出現穿孔。