小腸鏡檢查實際上主要是小腸疾病檢查，還有疾病隨診，以及少數息肉等疾病治療。患者做小腸鏡檢查原因具體如下：

1、不明原因消化道出血，胃鏡、腸鏡均查不到原因，懷疑小腸疾病或者不明原因缺鐵性貧血；

2、懷疑小腸腫瘤或者息肉等增生性疾病；

3、小腸克羅恩病，不管是檢查還是治療後隨訪，均需做小腸鏡；

4、其他器械檢查，比如做腸鏡、X線、CT、核磁等，懷疑小腸存在病變時，需做小腸鏡；

5、不明原因腹瀉或蛋白丟失性腸病時，需做小腸鏡；

6、不明原因小腸梗阻及外科手術後出現腸道病變，如有出血、梗阻，可做小腸鏡進一步檢查，明確問題具體部位；

7、胃鏡、腸鏡無法解決，懷疑小腸病變情況，可在小腸鏡下治療。