腎囊腫和腎腫瘤相對比較好鑑別，腎囊腫是液性、水性，腎腫瘤大部分是實質性。如果靠B超、CT也相對比較容易鑑別，腎臟腎囊腫在B超和CT上都會顯示水樣密度，腎腫瘤在B超和CT上都會顯示出實質性包塊。

從治療上來說，腎囊腫體積比較小時可以定期複查，等待觀察。腎臟腫瘤特別是惡性腫瘤，需要及時進行手術治療。腎腫瘤裡發生率比較小的腫瘤叫做囊性腎癌，與腎囊腫也有類似的地方。無論是囊腫還是腫瘤，建議患者到泌尿外科門診找醫生進一步的鑑別診斷。