橫紋肌肉瘤屬於惡性腫瘤，可往全身各處轉移，最常轉移的部位是肝、骨、骨髓、腦以及遠處肌肉和淋巴結。橫紋肌肉瘤可發生於全身各處，頭頸部最多，佔40%左右，泌尿生殖道25%，四肢佔20%。頭頸部橫紋肌腫瘤又分三個區域，即腦膜旁、眼眶及非眼眶以及非腦膜旁區域。

橫紋肌肉瘤早期即有25%發生遠處轉移，發生轉移非常早，而且非常容易遠處轉移，約40%-45%存在肺轉移，20%-30%存在骨髓轉移，骨轉移佔10%左右。發生在前列腺的腫瘤經常出現巨大的骨盆內腫塊，容易發生早期肺轉移。四肢和軀幹的包塊可能長得很大，可以累及胸腰段脊柱，但局部淋巴結蔓延較少。膽道腫瘤比較少見，也可有肝內轉移、腹膜後轉移以及肺轉移。