兒童化膿性骨髓炎通過充分積極治療一般可以治癒。但如果在急性骨髓炎早期處理不當，或者遷延時間較久，則會引起慢性骨髓炎。此時治療會比較棘手，治療效果也會較差，甚至後期會出現骨髓炎復發。

兒童化膿性骨髓炎的治療時機、療程十分關鍵，應徹底控制細菌，才能達到比較好的恢復效果。在小兒骨髓炎術後需要給予營養支持治療，提高抵抗力，防止骨髓炎再發。