兒童骨髓炎如果清創較好，抗生素使用得當，一般不容易復發。若抵抗力較差或者治療不徹底，在患者抵抗力下降、營養不佳、再次外傷的情況下，可能引起骨髓炎的再次復發。骨髓炎長期存在會有死骨形成，如果沒有徹底去除，也會導致骨髓炎的復發。

而骨髓炎復發時間並不確定，可以1-2個月後復發，也可能1-3年後再復發，與地區、國家的衛生狀況、衛生條件有關，如果衛生狀況較好，復發比例會相對較低。