疼痛在世界衛生組織分成五度，從0-Ⅳ度來分，0度不用特殊處理，能夠完全忍受的一種疼痛。骨髓穿刺的疼痛不像大家想象的那麼劇烈。可能比皮膚扎針稍微疼，因為要把針鑽到骨頭裡取骨髓血出來。一般在做穿刺前會局部打麻藥，如利多卡因，局麻阻滯神經疼痛，一般大家都能耐受。

具體分度可能在Ⅰ-Ⅱ度之間，不需要再給予其它特殊藥物來止痛。