關於藥物相關性骨髓炎的治療，曾經在2014年美國醫學會發布對於藥物相關性骨髓炎的臨床分類和指導治療的原則，現在臨床上治療基本上是遵循這個分類指導原則。零級或者一級可能主要採用一種非手術、非干預性治療，主要保持口腔衛生，定時進行沖洗進行治療，所以在處理上是相對比較保守的非侵入性治療。但是如果骨骼一旦已經發生長期暴露，並且發生骨質破壞、感染，就要進行手術治療。骨頭的壞死侵及到下頜骨，突破牙槽突，骨頭可能就要進行去除截斷，如果沒有可能僅僅把牙槽部分的骨骼去掉做蝶形的磨除，然後進行傷口的嚴密關閉就可以了。但是現在對於藥物性相關性骨髓炎的治療，在外科處理方面手段比較多，實際上沒有固定的手段可以收到一致的非常確定性的效果，所以這種治療技術也處於研究和發展過程中。