青少年的情緒障礙能夠治癒，病程大多較短暫，一般不會延續到成年期且預後良好。治療原則以心理治療為主，包括支持性心理治療、家庭治療和行為治療，具體情況如下：

1、支持性心理治療：在支持性心理治療當中，應該耐心傾聽患者內心的體驗，適當對患者的痛苦予以同情，同時指導患者適應環境，增加患者克服情緒障礙的信心。其次，患者要儘可能消除環境中的不良因素，如避免太多的家庭或學校的改變；

2、家庭治療：首先要了解患者的家庭結構和功能，評估引起焦慮的家庭的動力學的原因。糾正患者跟父母之間不良的親子關係，鼓勵父母強化患者的獨立能力，家庭治療的目的是讓患者的父母儘可能給予患者更多感情上的支持和交流；

3、行為治療：對於特定的恐怖障礙或社交障礙患者可以選擇暴露療法、系統脫敏療法等一系列方案，通過治療減輕患者症狀。對於年長的兒童可以進行認知治療，通過糾正患者對恐懼事物或情景不恰當的認知緩解焦慮情緒。

嚴重的青少年情緒障礙患者可以短時間內酌情使用苯二氮䓬類藥物或具有抗抑鬱作用的抗焦慮藥物，如氟伏沙明、舍曲林。