呼吸睡眠暫停綜合徵併發症比較多，對各個系統都有危害，具體如下：

1、對呼吸系統而言，間歇低氧可能導致呼吸衰竭，加重慢阻肺，加重阻塞性哮喘；

2、對於內分泌系統而言，如糖尿病，血糖很難調整、控制，原因為睡眠打鼾引起呼吸暫停、低氧，導致胰島素內分泌紊亂，從而導致血糖很難控制；

3、心血管系統：高血壓也同樣如此，包括心衰、肺心病。

4、患者可能會出現晨起頭痛、夜尿增多、白天嗜睡、精神不集中等症狀，在臨床上此類病人十分多見。

另外心律失常、高血壓的患者，對血壓、心率很難控制，同樣常見併發症，所以需要良好控制睡眠呼吸暫停，減少打鼾，減少低氧，從而阻止上述併發症的發生。此類病人如果是重度睡眠打鼾則還有發生猝死的風險，危害比較大，因此在臨床上需要引起足夠重視。