患者認為的扁桃體和醫生所說的扁桃體在概念上可能存在區別。醫生認為的扁桃體分為顎扁桃體、咽扁桃體、咽鼓管扁桃體、舌扁桃體等，而普遍所認為的扁桃體為顎扁桃體。

病人張嘴發出a的聲音的時候，在咽兩側部位可以看到突出表面的東西，有時突出表面提示可能是炎症反應。閉嘴後，舌頭所接觸的部分叫顎部，靠近牙齒的這部分叫硬顎，靠近咽喉的叫軟顎，軟顎向上延伸後分為前後兩弓，兩弓和舌根形成的三角形窩叫扁桃體窩，口咽部扁桃體就位於這個位置。

扁桃體位置較淺，是咽淋巴環的一部分，可分泌較多物質。如發生炎症，感染易在此處發生，形成扁桃體炎。