大部分咽喉部白色顆粒是因為咽喉部異常角化症，即咽角化症所致，主要發生於咽扁桃體和舌扁桃體，其它部位較少見。角化症多發生於30歲以前的年輕人，主要是由於局部口腔衛生不好、鼻淋巴濾泡炎症等引起。另外纖毛菌等細菌感染，可造成分泌物難以正常分泌，形成白色角化物，且貼附在表面不易剝離，比較堅硬，如石頭。

也可能是扁桃體方面的問題，如扁桃體結石，是因為在腺窩分泌的黏液分泌不暢聚集，加上本身帶有鈣化物結晶，即可形成結石。另外，扁桃體本身有炎症，導致阻塞，無法正常代謝，也可形成結石。表現為扁桃體表面出現白色顆粒物，還會引起口臭，且部分病人的口臭比較明顯。