扁桃體發炎細菌、病毒感染都有，早期時多半是病毒感染造成，但是病毒感染多數都會繼發細菌感染，尤其亞洲人比較常見，因為本身由於基因或者由於飲食習慣或生活習慣，可能鍛鍊平時少，亞洲人種在免疫力方面有時不如西方人免疫力強。但可能平時通過經常鍛鍊，飲食結構調整，也可以達到免疫力很好的情況，在免疫力很好時，病毒感染可以自愈，不用吃抗生素即可。

但一旦出現了急性化膿性扁桃體炎、細菌感染時，還要儘早給予抗生素治療，這時需要找大夫診斷到底是細菌還是病毒感染引起。因為如果要是細菌感染，不給予抗生素治療，病程進展會很快，有時可能會引起很嚴重的扁桃體周圍炎、扁桃體周圍膿腫，會造成很嚴重的問題。