治療食管炎首先需去除造成食管炎的因素，如為刺激的外源性因素，需避免食用對食管黏膜損傷的食物或藥物；生活習慣需三餐規律，避免過飢、過飽；飲食習慣需避免飲酒、濃茶、咖啡；食管炎可進行常規藥物治療，如嚴重食管炎造成食管狹窄需進行食管支架植入微創手術；造成食管潰瘍出血需應用止血類藥物；食管炎出現併發症如嚴重的食道狹窄、Barrett食管甚至食管癌則需進行外科手術治療。