痛經最常見的檢查是盆腔B超，明確子宮雙側附件有無病變，如卵巢子宮內膜異位症、子宮腺肌症，如果是病變引起的繼發性痛經，需要醫療干預。
超聲是首選檢查方式，還可以做血液化驗，查CA125指標，看有沒有異常升高，有助於判斷痛經的嚴重程度。嚴重的患者建議做盆腔核磁共振，因為盆腔核磁可以比較細緻的分辨除了子宮卵巢之外有沒有子宮內膜異位症的問題。