臨床血培養通常採集靜脈血，較少採集動脈血。人體血液分動脈血和靜脈血，動脈血通常行經位置較深，採集要比靜脈困難，而且其壓力也比較大，如果穿刺不當或者壓迫不好，較容易形成假性動脈瘤或者動脈出血，而產生嚴重的併發症。

血培養的目的是檢出血液中的感染的病原菌，診斷血流感染。動脈血血流速度快、二氧化碳分壓低、氧分壓高。而細菌在血液流動緩慢、二氧化碳分壓相對較高的環境，更容易存活、繁殖，採集靜脈血的陽性率會明顯高於動脈血。因此進行血液培養應該採集靜脈血，不要採集動脈血。

但是大面積燒傷的病人的血管確實不好找，沒有辦法時也可採集動脈血進行血培養。在實驗室進行細菌培養時，通常放在5%-10%的二氧化碳分壓的環境裡進行培養，這種環境下細菌會生長得較好。