大腸桿菌是革蘭陰性腸桿菌當中的一種，是大腸埃希氏菌屬裡的一種，有動力、鞭毛，在鏡下用鹽水看其動力呈翻滾運動，正常實驗室檢測需要用全自動微生物鑑定儀做鑑定，也可以用質譜儀檢測。

臨床上有鑑定的顯色平板，是針對大腸埃希氏菌的顯色平板，現在也有銷售，可以直接通過顯色平板檢測。大腸埃希氏菌，一般吲哚試驗都陽性。如果是在國產的鑑定平板上，可以看到吲哚試驗陽性，VP試驗一般都是陰性，動力陽性。