臨床上支原體肺炎治療的首選藥物是大環內酯類藥物，如阿奇黴素、羅紅黴素、紅黴素、克拉黴素等。阿奇黴素注射液治療支原體肺炎的療程，一般為2-3周，具體要根據患者的病情，來適當調整療程。

支原體肺炎有自限性，多數患者不治自愈，早期可適當使用阿奇黴素等抗生素，減輕症狀，縮短病程。對於劇烈嗆咳者，還應適當使用鎮咳藥，如氫溴酸右美沙芬、氨酚雙氫可待因等，絕大多數患者2-3周可達到痊癒的效果。但對於老年患者，或伴有某些慢性基礎疾病的患者，反覆出現支原體肺炎時，具體的療程可能會適當的延長。對於病情較重的患者，應加強支持治療，出現肺外併發症時，也應針對性處理，對於縮短病程有所幫助。

使用阿奇黴素注射液治療支原體肺炎時，應在專業醫生指導下進行治療。在恢復期對於副作用比較敏感，或再次交叉感染的情況，需視情況予以增減用量和用藥時間。