馬凡氏綜合徵的存活時間與發現時期、治療時機和病情程度有關。未經治療患者的自然壽命約為30多歲，少數患者可超過40歲；

如早期發現並進行主動脈根部手術、二尖瓣修復等治療，可延長壽命。

部分馬凡氏綜合徵患者主動脈表現較廣泛，除根部病變還有胸主動脈、腹主動脈病變，其預期壽命也與主動脈瘤變發生、發展和控制程度有關，但由於沒有早期發現，形成主動脈夾層動脈瘤幾率增大，可有猝死風險。