頭痛是高原反應較為常見的症狀，一般經過休息、吸氧等對症治療，1-2天后症狀便可以有明顯緩解，而完全適應高原環境可能要1-2周。所以患者頭痛在48小時後會明顯緩解，2周左右才可能完全消除。患者進入高原地區後出現頭痛，主要是由於人體突然暴露於低壓、低氧的環境中，從而產生一系列不適應症狀，頭痛主要表現為額頭和雙側太陽穴的脹痛。此時患者應立刻臥床休息，同時給予低流量吸氧，大多數患者症狀會明顯減輕。如果頭痛劇烈，可以口服阿司匹林、對乙酰氨基酚、布洛芬等藥物進行對症止痛治療。如果因頭痛影響入睡，還可以加服安定片幫助入睡。

經過上述的休息、吸氧和藥物治療，患者通常在2周左右會完全適應高原環境，頭痛等高原反應症狀便完全消失。如果經上述治療後，頭痛症狀沒有減輕甚至明顯加重，應儘快將患者送往低海拔地區，以免造成嚴重的腦血管疾病。此外，高原反應可以預防，如可以使用階梯式上升的方法，通常在2000-2500m海拔地區停留2-3天，然後按照每日海拔增高600m左右的速度，循序漸進進入高海拔地區。