扁桃體發炎引起頭疼，在臨床上較為常見，主要原因具體如下：

1、可能為細菌感染後毒素吸收，反射性引起頭疼；

2、另外扁桃體發炎的患者，尤其為急性炎症，會導致發熱，從而引起頭疼。

扁桃體發炎在臨床上，分為急性扁桃體炎和慢性扁桃體炎。急性扁桃體炎，常因細菌感染而導致，常見的細菌為乙型溶血性鏈球菌及葡萄球菌，感染後患者會出現咽痛，吞嚥時疼痛加劇，還有發熱、周身乏力、精神食慾差等症狀。檢查可以發現扁桃體急性充血、水腫，嚴重的情況會出現膿性分泌物。治療上首選頭孢類抗生素，配合局部漱口，以緩解全身中毒症狀。

慢性扁桃體炎，多因機體免疫力下降，急性扁桃體炎反覆發作而導致，患者平時症狀較輕微，有輕微的咽乾、咽部不適、咽痛、異物感、咳痰等症狀。檢查可以發現扁桃體慢性充血，舌顎弓黏膜增生、肥厚，與扁桃體組織粘連。治療上以生理鹽水漱口，或者咽喉部理療、銀黃含化、華素片含化等局部治療，臨床效果良好。如慢性扁桃體炎引起全身併發症，為手術摘除的指徵。