琥珀酰膽鹼禁用於重症肌無力患者，重症肌無力是自身免疫性疾病，即神經肌肉接頭處的突觸後膜的自身免疫抗體產生，使乙酰膽鹼不能與突觸後膜的膽鹼抗體相結合，而出現重症肌無力的症狀。如果用琥珀酰膽鹼治療或患者誤用琥珀酰膽鹼，會加重重症肌無力的現象，甚至出現肌無力危象，導致患者出現呼吸困難，甚至有生命危險。

對於重症肌無力患者，需禁用導致加重重症肌無力的藥物，如琥珀酰膽鹼、美洲筒箭毒鹼。部分抗生素也需禁用，主要包括鏈黴素、慶大黴素、四環素等藥物，同時苯妥英鈉、奎尼丁等藥物，也會抑制肌肉的收縮，而加重重症肌無力的症狀。