重症肌無力的病因目前不明確，推測可能原因由胸腺免疫器官中肌樣細胞與骨骼肌結構類似，在病毒等感染的情況下，身體進行免疫識別，可能產生肌肉相關的抗體，此抗體與神經肌肉接頭突觸後膜的乙酰膽鹼受體進行結合，就阻止突觸間隙的乙酰膽鹼與突觸後受體結合，而導致肌肉的一種病態疲勞，對運動不耐受。

運動時間過長後就會出現肌肉無力的症狀，從而導致重症肌無力，通常會累及眼外肌、面肌、咽喉部肌肉，以及四肢的骨骼肌等。治療包括對症治療，還可以使用胸腺切除，以及免疫製劑治療。