小兒腦膜炎可以治癒，本質上腦膜炎是局部器官炎症，目前醫療水平下抗炎藥物較多，如果發現及時，致病菌不耐藥情況下炎症影響可以降到最低。

有時病情診斷可能不及時或可能致病細菌耐藥，或病原體本身致病能力較強，剛發生時對腦細胞已經產生嚴重損傷導致腦神經元細胞死亡。同時腦細胞死亡不能再生，少量神經元死亡時功能損傷可以通過康復代償，但較多神經元死亡以後對應神經功能必然受損，產生相應後遺症較難治癒。