隱球菌腦膜炎是少見病、罕見病，往往多見於獲得性免疫缺陷的患者，見於做過器官移植，如肝移植、腎移植的患者。還可見於免疫功能正常的患者，這類免疫功能正常的患者認為可能存在隱匿性免疫功能缺陷。在這類患者中，部分可追溯病史，有可能養殖或者接觸鴿糞，或者接觸久置櫥櫃、發黴的稻穀。

此外，隱球菌腦膜炎是顱內炎症，不是呼吸道傳染病，目前沒有證據證明人和人之間會傳染，所以隱球菌腦膜炎不會傳染。作為家屬或者護理人員來說不需要太過於緊張，保持房間通風即可。