隱球菌廣泛存在於泥土中，並且在鴿糞中含有大量的隱球菌。對於存在有免疫缺陷的患者、器官移植的患者、長期服用免疫抑制劑的患者及有基礎疾病，如肝炎、糖尿病、肺結核患者，儘量減少或者避免暴露在有大量隱球菌的環境中，是減少感染隱球菌的重要措施之一。

如果患者出現劇烈頭痛、嘔吐、發燒，無法用其他原因解釋，應早期進行隱球菌感染篩查，比如墨汁染色，做隱球菌莢膜多糖抗原檢測，明確是否有隱球菌感染。如果能夠早期確診，早期給予積極治療，能夠達到完全治癒狀態。