腦膜炎後遺症要根據損傷程度判斷，如果損傷程度比較重，如有些人出現腦膜粘連，造成顱底神經損傷可能有後遺症。還有人會出現局灶性病灶，造成肢體功能的喪失，表現為精神行為異常。

如果腦炎比較重，會引起後遺症，還要評估患者的治療效果，如果在急性期的治療效果不好，可能引起後遺症。部分腦膜炎恢復比較好，基本患者日常生活沒有影響，比如最常見病毒性腦炎，並沒有產生任何後遺。所以要根據腦膜炎的類型、損傷程度，才能判斷是否有後遺症。