腦膜炎有很多種類型，包括病毒性腦膜炎、細菌性腦膜炎、真菌性腦膜炎等。病毒性腦膜炎有治癒傾向，大部分病毒性腦膜炎通過積極的抗病毒感染治療可以得到治癒，很少有後遺症。細菌性腦膜炎和真菌性腦膜炎，感染的症狀會非常重，如果不能夠得到及時有效的治療常會有後遺症，比如偏癱、失語、智力下降甚至昏迷。對腦膜炎要首先明確診斷，是病毒性腦膜炎、細菌性腦膜炎，還是真菌性腦膜炎，明確診斷以後根據不同的病原體給予正確治療。
細菌性腦膜炎要給予敏感的抗生素應用，因為有血腦屏障的存在，選擇抗生素的時候要儘量選用能夠透過血腦屏障的抗生素或鞘內給藥，使得腦脊液血藥濃度明顯升高，有利於感染的控制。真菌性腦膜炎，比如隱球菌腦膜炎，症狀也會非常重，給予積極的抗真菌治療，通過正規的治療能夠及早的控制住感染，才能夠避免後遺症的發生。