雖然病毒性腦膜炎是自限性疾病，但是不同病毒有不同致病性，不同人患病後嚴重程度不同。因此，天生體質弱、免疫缺陷或者抵抗力低下的病毒性腦膜炎患者、尤其是老年患者、營養不良的兒童患者，如不進行抗病毒、支持治療等處理，病情會逐漸加重，或者較其他病人恢復慢。如有的人七天會好，有的人不注意會遷延半個月至1個月，甚至留下頭痛等後遺症。