顱內感染主要因為感染各種生物病原體，引起中樞神經系統感染。和身體其他部位的感染一樣，感染包括病毒、細菌，還有衣原體以及立克次體、真菌等微生物。感染途徑包括血液感染，如蚊蟲叮咬或者動物咬傷。夏天經常多見蚊蟲叮咬，動物咬傷可能會感染狂犬病，也屬於病毒感染。還有治療過程中不衛生的注射、輸血，或者面部感染。如面部危險三角區感染，從鼻根部到嘴角這一塊屬於危險三角，這個部位感染後會傳到顱內，引起顱內感染。