新生兒溶血性貧血大部分可以治癒，但不是所有的都可以被治癒，比如先天遺傳性的地中海貧血、遺傳性球形紅細胞增多症等較難治癒。

臨床最常見的新生兒溶血性貧血是血型不合所致，大多是ABO溶血，或者是Rh血型不合導致的溶血性貧血。這種貧血常發生在嬰兒出生時，所以只要在嬰兒出生的時候給予及時治療，嚴重時可以進行換血治療，通常可以治癒，之後也不會再發生。

部分新生兒出現溶血性貧血是先天性疾病，如先天性遺傳性地中海貧血，由於先天遺傳因素導致，臨床上比較難治癒，可以通過誘因預防，儘量避免貧血發生或者加重。對於遺傳性球形紅細胞增多症，這類溶血性貧血可以在孩子滿6歲之後積極進行切脾治療，通常能夠達到緩解的效果，使貧血糾正、黃疸消失，雖然不能治癒，但是症狀能夠明顯緩解。