腎病綜合徵最常用的細胞毒藥物是環磷酰胺，這是一種免疫抑制劑，也是一種烷化劑。這個藥物可以破壞細胞DNA的結構和功能，抑制細胞分裂和增殖，是臨床上治療原發性腎病綜合徵最常用的細胞毒藥物，可以口服使用，也可以靜脈注射使用。

一般來說，對於腎病綜合徵的治療來說，最常用的方法是口服，患者需要每日每公斤體重2mg的劑量，分2-3次服用。患者用這個藥物總量一般需要達到6-12g，用藥之前需要多飲水，避免睡前服藥。還需要監測這個藥物的各種副作用，比如出血性膀胱炎、骨髓抑制、肝功能損害等等，這是一種對人體副作用相當明顯的藥物，需要嚴格遵照醫囑使用。現在也有新型免疫抑制劑，包括環孢素、他克莫司、黴酚酸酯等。